طرح «استقلال آب و فاضلاب روستایی از آب و فاضلاب شهری»، با هدف توجه به عمران، آبادانی و پیشرفت روستاها و جلوگیری از مهاجرت بی رویه روستاییان به شهرها، تهیه شده است. در این طرح پیشنهاد شده است که مدیریت شرکت های آب و فاضلاب شهری و روستایی مجدداً از یکدیگر تفکیک شده و ردیف های بودجه آنها مستقل از هم در قوانین بودجه آورده شوند. موضوع یکپارچه سازی و ادغام شرکت های آب و فاضلاب شهری و روستایی در سنوات گذشته بارها مطرح بوده تا اینکه سرانجام در سال 1398 این شرکت ها یکپارچه شده و در حال حاضر در قالب شرکت های آب و فاضلاب استانی مشغول به فعالیت هستند. ادغام و یکپارچه سازی شرکت های آب و فاضلاب شهری و روستایی دارای مزایا و معایبی است که ازجمله مزایا می توان به حذف 31 شرکت دولتی از زیرمجموعه دولت و کاهش تعدادی پست رسمی سازمانی دولتی، کاهش هزینه ها، یکپارچه سازی نظام برنامه ریزی منابع آب در هریک از شرکت ها، یکپارچگی ضوابط و مقررات مربوط به منابع انسانی، تسهیل اعمال وظایف و مسئولیت های حاکمیتی در بخش آب و آب و فاضلاب، همسویی سازمانی شرکت ها با تغییرات تقسیمات کشوری و کاهش مشکلات مربوط به بهره برداری از تأسیسات و منابع مشترک اشاره کرد. ازجمله تهدیدها و ابهام های این ادغام نیز عبارت است از: لزوم تعیین چگونگی اعمال نظام تعرفه در شرکت های یکپارچه برای شهر و روستا، لزوم تعیین تکلیف نحوه تأمین مابه التفاوت نرخ های تکلیفی و واقعی خدمات در این شرکت ها، انتقال مطالبات و تعهدات مالی شرکت های دولتی به شرکت های جدید، افزایش زیان انباشته در شرکت های جدید و نحوه تداوم دریافت کمک به زیان برای بخش روستایی و چگونگی ادامه دریافت اعتبارات خاص غیرانتفاعی حوزه روستایی شرکت های یکپارچه در ردیف های بودجه. با عنایت به مزایا و معایب یکپارچه سازی و با توجه به اینکه این اقدام در سال 1398 نهایی و اجرایی شده است، بازگرداندن ساختار قبلی و تغییرات ساختاری پی درپی در حالی که جابه جایی ها و انتقال نیروی انسانی انجام شده و نقل و انتقال اموال و دارایی های این شرکت ها نیز در دست انجام است و با توجه به اهمیت این بخش برای تأمین آب و امور فاضلاب مرتبط به جوامع شهری و روستایی، می تواند موجب آشفتگی و عقب ماندگی از برنامه ها شود. بنابراین با عنایت به مطالب عنوان شده، تصویب طرح «استقلال آب و فاضلاب روستایی از آب و فاضلاب شهری»، پیشنهاد نمی شود.